制定《军人权益保障暂行管理办法》，提交重庆镇抚府谘议局表决通过，以从法律角度上保障军人合法权益。

根据军人权益暂行管理办法，建立军令部，由副军长熊克武担任军令部部长。以主管各地对民团管理，退役工作管理。

建立军功制，以此增加全军上下荣誉意识。

根据战士在战斗中杀敌人数、和平建设中贡献，设立相应的荣誉，按照立功大小，分一等攻与三等功，奖励标准为：

一等功：在三年以上军伍生活中，做出有特殊功绩的个人或集体；

二等功：在某一战役当中曾经转移战局而获得伟大胜利的个人与集体；

三等功：发给经常表现英勇坚决的个人与集体。

一等功、二等功需要军以上才有资格颁发，三等功需要旅以上集体才有资格颁发。

申请各级功勋的，需要单位评比，层层审核方可。

旅只能颁发给连级以下集体或个人。

军只能颁发给营、团以下个人或集体。

另对立了二等功以上个人，在战争结束后，可保送到振武堂学习。

另有10个单位获得集体3等功。

在这次护国战争中，有34人荣获个人二等功，281人荣获个人三等功。

对战死者，战争受伤不能继续服役的，除了发放抚恤金，就是为其小孩或者家里部分亲属补助一定教育学费。

通过对英雄、战死者应有的尊重，以鼓舞荣誉制度的建立。

对战死士兵，由当地划分1定区域，修建烈士陵园。